在做文献调研、合成路线比选，还有课题开题的时候，有一个情况是挺常见的，就是Reaxys的反应路线为什么总是查不全，以及在筛选这些路线的时候，哪些条件是特别容易被漏掉的，很多人可能会以为，只要把一个目标化合物的结构输进去，系统就应该自动把所有能用的路线都给列出来，可真到检索的时候，常常会发现，对着同一个目标物，有时候只出来寥寥几条路线，可换一种结构画法再去搜，又能多跑出一大批结果，这是因为Reaxys对反应路线的检索，并不只是单纯地看目标分子的名字，它还会被结构的绘制方式、反应中扮演的角色、文献的类型、收率的范围、步骤的数量、试剂的条件，还有数据筛选的逻辑这些因素给影响到，所以，当查不全的时候，就需要我们从检索的入口和筛选的条件这两个方面，一起去排查。

　　一、Reaxys反应路线为什么总是查不全

　　Reaxys的反应路线查不全，一个常见的原因是，我们想要检索的那个目标，没有被系统准确地理解，特别是对于那些结构式里盐型、异构体、保护基和相似中间体比较多的化合物，在输入方式上哪怕只是一点点细微的差别，返回来的结果都可能会发生很明显的变动。

　　1、结构画得太过于精确了

　　如果我们在画结构的时候，把立体的构型、盐的形态、水合物、同位素的标记，或者特定的保护基，一样不落地全画了进去，系统就有可能会只返回那些高度匹配的反应，在做路线搜集的时候，其实可以先用目标物的母体结构去进行检索，然后再一步一步地去增加立体的化学信息、官能团保护的形式，还有取代基的限制，这样做，就比较容易判断出来，返回的结果少，到底是少在了结构条件上，还是少在了反应数据本身。

　　2、只用了名字却没有去核对结构

　　化合物的名称、商品名、缩写，还有CAS号，它们在数据库里面，是有可能会对应到不同的记录上去的，所以比较建议的做法是，检索完了之后，先点开化合物的详情页面，去核对一下它的结构式、分子式还有那些同义的叫法，如果用名称找不到路线，不要马上就断定数据库里没有收录这个东西，可以试着换成用结构去检索，或者用它的核心骨架，带上关键的取代基，重新再画一遍。

　　3、目标物在反应里的角色被选错了

　　在检索反应路线的时候，我们需要去确认一下，这个目标物是以产物、反应物还是中间体的身份出现的，有的人会把目标物放在普通物质的检索里面去查看结果，却没有切换到反应路线的那个视角；也有的人在做反应检索的时候，没有把目标物限定为产物，结果就混进来一大堆不相关的反应，那些真正有用的路线，反而被挤到了很后面的位置。

　　4、路线步数的限制设得太窄了

　　如果我们只盯着一步就能完成的反应，那就会漏掉很多需要多步合成的路线；如果只看系统给推荐出来的路线，又可能会错过那些散落在文献里面、却非常重要的关键中间体，查找路线的时候，我们可以先看看目标物是怎么被制备出来的这些反应，然后再反过来去推那些关键的中间体，必要的时候，可以把一步反应和多步的路线分开来查，不要只是依赖一个结果的页面。

　　二、Reaxys反应路线筛选时哪些条件最容易漏设

　　在对Reaxys的反应路线进行筛选的时候，容易漏掉的，往往不是哪一个显眼的按钮，而是几个看起来不怎么起眼的限制条件，筛选的条件要是没有设置好，结果会显得非常杂乱；可要是设得太死，很多有用的结果又会被直接过滤掉。

　　1、反应角色的条件

　　在筛选的时候，要看清楚目标化合物在结果里，到底是作为产物、起始的物料、试剂还是催化剂出现的，路线调研通常会把重点放在产物和中间体上，要是这个角色没有被限定，页面里就会混进很多把该化合物用在其他反应里的记录，看着结果好像很多，但真正能用来合成它的路线，反而不太容易找出来。

　　2、文献和数据的来源条件

　　对路线进行筛选，不能光是看数量的多少，还得看它的来源是哪里，专利、期刊、综述，还有实验数据的记录，它们的写法是不一样的，路线的完整程度也不一样，在做早期调研的时候，可以把专利和期刊的结果都保留下来；可到了做工艺可行性判断的时候，就要重点去关注那些有具体实验条件、投料量、收率和后处理描述的记录了。

　　3、收率范围的条件

　　不少人会直接把收率设得很高，结果反而把一些很关键的路线给过滤掉了，在实际筛选时，可以先不急着去设置收率的上限和下限，先去看看路线的类型和反应条件，等有了一个大概的了解之后，再用收率去做第二步的筛选，一条收率比较低的路线，不一定就没有参考的价值，它有可能会提供一个可以替代的底物、一个关键的中间体，或者是一个反应的大方向。

　　4、试剂和催化剂的条件

　　在筛选路线的时候，很容易只盯着目标物和产物的结构去看，却忘了把那些明显不太合适的试剂条件给筛掉，比如说，贵金属的催化、高危险的试剂、强腐蚀的体系、低温的反应、特殊的气氛要求，这些都会影响到实际能不能用，我们可以先做一个初筛，然后再按照试剂、催化剂、溶剂和反应条件，一步一步地把范围给收窄。

　　5、时间和文献年份的条件

　　对年份的筛选，也是比较容易用错的地方，如果只看最近这几年的文献，就有可能把一些经典的路线给漏掉；可要是只盯着早期的路线看，又可能会忽略掉后来改良过的那些条件，一种比较稳当的做法是，先不去限制年份，把主要的路线类型都整理出来，然后再按照时间的顺序去看一看，后来有没有条件被优化过、有没有出现可替代的试剂，或者工艺上有没有什么改进的记录。

　　三、Reaxys反应路线筛选条件应怎样反查

　　对Reaxys路线的筛选，不太适合一下子就设完所有的条件，它更适合一边查一边放宽、一边又去收窄，在每一次筛选过后，我们都要去判断一下，结果变少的原因到底是什么，而不是一看到结果少，就直接去换关键词。

　　1、先做一个宽范围的检索

　　我们可以先用目标的结构，去做一个条件比较宽松的反应路线检索，先不着急去限制收率、年份、文献的类型还有试剂，这样做的好处是，可以先摸清楚数据库里面大概都有些什么样的反应方向，免得一上来，就把那些有价值的路线给挡在了外面。

　　2、接着再按照路线的用途去筛选

　　如果是做论文调研，那就要重点去看文献的出处、反应的条件还有能不能复现的那些描述；如果是做工艺的比选，那就要重点去看步骤的数量、原料能不能方便地买到、有没有用到危险的试剂、放大的可能性有多大，还有后处理起来困不困难，目的不一样，对应的筛选条件也就不一样，不要用同一套规则去查所有的项目。

　　3、利用中间体去反推路线

　　当目标物出来的结果很少的时候，我们可以从它相邻的中间体入手，先去找目标物上一步的反应，然后，再把上一步的起始物料，当成新的目标去继续反查，这样做虽然比直接检索路线要慢了一些，但是却常常能把那些藏在单步反应记录里的路线链，给补出来。

　　4、把筛选的过程记录给留下来

　　每一次改动了结构、反应的角色、文献的类型、收率或者试剂的条件，都可以简单地记一下，这样到了后面去评审路线的时候，就能说清楚，哪些结果是数据库里真的没有，哪些结果是被我们自己设置的条件给筛掉的，又有哪些路线是因为风险高或者成本贵，而被排除掉的。

　　总结

　　Reaxys的反应路线老是查不全，以及在筛选时哪些条件最容易漏设，主要的问题，往往是出在了结构的表达、反应的角色、路线的步数，还有筛选的逻辑这些地方，在检索的时候，我们先用宽泛的条件看一看大致的全貌，再按照文献的来源、收率、试剂、年份还有路线的具体用途，一步一步地去筛选；当出来的结果偏少时，不要只是去换一个名字，可以用结构检索、中间体反推，还有把条件放宽这些办法，去做补充的查询，用这样的思路整理出来的反应路线，才更适合去给后续的合成方案比较，还有实验的设计，打下一个牢靠的基础。